Pencak silat sendiri memiliki induk organisasi di Indonesia dengan nama Ikatan Pencak Silat Indonesia (IPSI). Dalam organisasi ini, sosok Prabowo sangatlah dikenal.

Dia bahkan pertama kali terpilih sebagai Ketum Pengurus Besar (PB) IPSI pada tahun 2004 silam. Kemudian, pada Munas PB IPSI di Taman Mini Indonesia Indah (TMII), pada Februari 2012 lalu, dia kembali terpilih untuk ketiga kalinya sebagai ketum PB IPSI.