Sempat menjalani karir junior untuk klub Fortuna Magdeburg dan FC Magdeburg, Schmeizer juga pernah merasakan akademi junior Borussia Dortmund sejak tahun 2005 dan dua tahun berselang dirinya masuk ke dalam tim senior. Sejak saat itulah pemain asli Jerman ini menghabiskan karirnya untuk Dortmund. Debutnya bersama tim juga berkat kepercayaan yang diberikan oleh Juergen Klopp untuknya.