Kongres Luar Biasa PSSI memutuskan untuk memaksa mundur La Nyalla usai dirinya ditetapkan sebagai tersangka kasus pencucian uang dalam pengolaan dana hibah Kamar Dagang dan Industri Jawa Timur 2011 hingga 2014, meski pada Desember 2016 lalu, ia diputuskan tidak bersalah oleh Pengadilan Tipikor Surabaya.

Posisinya tersebut untuk sementara digantikan oleh Hinca Panjaitan yang menjabat sebagai Pelaksana Tugas Ketua Umum PSSI. Pergantian tak hanya berhenti sampai di ketua umum, namun juga deretan jabatan lainnya, terutama sederet anggota komite eksekutif.

Mayoritas pihak dalam Kongres Luar Biasa PSSI tersebut memaksa La Nyalla mundur dari tampuk kepemimpinannya karena dianggap gagal usai terlibat dalam kasus hukum yang melilitnya. Ia pun tak mampu menyelesaikan masa jabatannya hingga 2019 mendatang.