Pelatih Persija, Stefano Cugurra melakukan pergantian pemain di babak kedua usai tertinggal 1-2. Addison Alves masuk  menggantikan Rudi Widodo untuk menggempur pertahanan PSMS Medan, sebelumnya Ayam Kinantan juga melakukan pergantian pemain dengan menarik Abdul Rohim dan menggantinya dengan Dika Bhayangkara.

Jaimerson nyaris membuat gol untuk Persija di menit ke-50. Beruntung Lobo melakukan penyelamatan gemilang untuk mengamankan gawang PSMS.

Alih-alih mencetak gol, Persija justru kembali tertinggal setelah Suhandi mencetak gol di menit 56. Gol indah Suhandi usai menerima umpan Abdul Aziz membuat PSMS unggul 3-1.

Persija berusaha menyerang usai tertinggal 3-1, Simic nyaris mencetak gol di menit 62, sayang tembakan kerasnya masih dapat dihalau Dhika Bhayangkara. Ramdani juga membuat peluang emas enam menit berselang, sayang pertahanan PSMS masih dapat menahannya.

Persija beberapa kali membuat peluang berbahaya, namun sayang taka da satu pun gol yang tercipta untuk Macan Kemayoran. Hingga wasit meniup peluit panjang tanda berakhirnya babak kedua, PSMS sukses mempertahankan keunggulan, 3-1.