Tahun 1996, The Academy memulai era baru dengan hadirnya Rio Ferdinand dan Frank Lampard. Dan pada tahun itulah, West Hame U-23 mencapai final Piala FA U-23, meskipun saat itu dikalahkan oleh Liverpool U-23 yang diperkuat Michael Owen. 

Tiga tahun berselang, barulah West Ham U-23 menjuarai Piala FA. Saat itu, West Ham U-23 diperkuat oleh Joe Cole dan Michael Carrick. Sembilan tahun berselang, Ferdinand, Carrick, Lampard dan Joe Cole saling berhadapan di final Liga Champions antara Man United melawan Chelsea. 

Sejak tahun 1960-an, banyak pemain bintang yang ditelurkan akademi ini. Beberapa diantaranya adalah, Bobby Moore, Geoff Hurst, Martin Peters, Frank Lampard Sr, Harry Redknapp, Trevor Brooking, Alan Curbishley, Alan Devonshire, Alvin Martin, Tony Cottee,  serta Paul Ince. 

Selanjutnya, ada nama Rio Ferdinand, Frank Lampard Jr, Joe Cole, Michael Carrick, Jermain Defoe, dan Glen Johnson. Ada anggapan bahwa jika West Ham tak menjual 6 pemain ini, maka dipastikan West Ham akan merajai Liga Primer Inggris selama beberapa musim.