Di tengah masa keemasannya bersama Juventus, tiba-tiba kabar mengejutkan datang. Bonnuci dijual ”murah” ke AC Milan dengan harga hanya 40-45 juta euro ditambah bek sayap Mattia De Sciglio. Padahal Bonnuci juga diincar klub-klub besar dengan bayaran ”wah” seperti Chelsea dan Barcelona.

Spekulasi bermunculan. Ada kabar bahwa pelatih Juventus Massimiliano Allegri menyalahkan Bonnuci karena tidak tampil baik saat Juventus kalah telak 1-4 melawan Real Madrid di final Liga Champions Eropa 2016/2017. Dan masih banyak kesimpang siuran lainnya. Tetapi Bonnuci membantah semua isu keretakan hubungan dengan klub lamanya sembari mengatakan semua baik-baik saja.