Babak kedua dimulai, dengan kedua tim bermain secara tertutup. Tidak terbuka seperti babak pertama tadi, baru pada menit ke-53, Barito mendapat peluang namun masih bisa digagalkan oleh Andritany.

Barito masih terus mencari ruang untuk menekan Persija Jakarta. Namun bermain di depan ribuan Jakmania, membuat Persija bermain dengan sangat rapih dalam transisi bertahan ke menyerang.

Alih-alih mencetak gol, Barito Putera malah kembali kebobolan di menit ke-74. Marko Simic menggiring bola ke depan kotak penalti usai diumpan oleh Bambang Pamungkas, tendangan keras mendatar masuk ke gawang Barito.

Menit ke-80, Persija mulai mengendurkan permainan mereka dan lebih fokus bertahan. Barito juga tidak dapat mengembangkan permainan mereka dalam 10 menit terakhir pertandingan.

Hingga wasit meniup tanda pertandingan berakhir, babak kedua Persija Jakarta vs Barito Putera pun berakhir dengan kemenangan 3-0 untuk tuan rumah.