Usai istirahat babak pertama, Madura United tetap bermain seperti awal. Permainan cepat yang diarahkan ke sisi sayap kerap membahayakan.

Beberapa kali umpan-umpan matang Zah Rahan mengarah ke dalam kotak penalti lawan. Akan tetapi para penyerang Madura United, Greg, Rakic, Beto, hingga Andik tak bisa membobol gawang lawan.

PSS Sleman juga bukannya tanpa peluang sedikit pun. Sejumlah serangan balik dilancarkan Super Elang Jawa masih bisa dipatahkan bek-bek Laskar Sapeh Kerrab.

Menjelang lima menit akhir babak kedua, Alfath Fathier sukses mencetak gol usai turun sebagai pemain pengganti. Operan Rakic mampu dimanfaatkan dengan baik.

Hingga wasit meniup peluit tanda berakhirnya babak kedua, tak ada gol tambahan. Sehingga Madura United menang 2-0 dari PSS Sleman.