Jonathan Reis mengawali karier profesionalnya bersama klub raksasa Belanda, yakni PSV Eindhoven. Meski masih terdaftar sebagai pemain di tim muda PSV, namun dirinya juga sesekali tampil untuk skuat utama klub tersebut.

Itu pun menjadi sebuah prestasi tersendiri bagi pemain muda. Karena tak semua pemain muda bisa mendapatkan kesempatan bermain untuk tim senior PSV Eindhoven.

Terhitung, Jonathan Reis bertahan selama kurang lebih tiga musim bersama PSV Eindhoven. Dirinya juga sempat dipinjamkan ke klub asal Brasil, Tupi FC, pada 2009.

Sekedar informasi, pemain berkebangsaan Brasil tersebut telah mengumpulkan 19 gol dan enam assist dalam 68 pertandingan di Eredivisie bersama PSV Eindhoven.