Di Piala Indonesia edisi pertama yaitu 2005, Javier Roca yang merengkuh gelar top scorer bersama Persegi Gianyar. Di Piala Indonesia 2005 sendiri diketahui kalau Arema Malang yang menjadi juara usai mengalahkan Persija Jakarta di Gelora Bung Karno (GBK).

Langkah Persegi Gianyar sendiri terhenti di babak perempatfinal usai kalah dari Arema Malang, tim yang menjadi juara di akhir turnamen. Meski gagal membawa Persegi Gianyar juara, setidaknya Javier Roca bisa memamerkan gelar top scorer dengan catatan 10 gol.

Emaleu Serge (Arema Malang)

© Wearemania

Emaleu Serge, mantan bomber Arema Malang

Untuk edisi 2006, sesungguhnya ini merupakan anomali karena menjadi satu-satunya top scorer yang sukses mengantarkan timnya jadi juara Piala Indonesia. Adalah Emaleu Serge dengan 6 golnya yang sukses membawa Arema Malang juarai Piala Indonesia.

Di babak final, Arema Malang sukses mengalahkan Persipura Jayapura dengan skor 2-0 melalui gol dari Aris Budi Prasetyo dan Anthony Jomah Ballah. Gelar di edisi 2006 membuat Arema Malang sukses meraih back to back Piala Indonesia setelah juara juga di 2005.