Radja Nainggolan bergabung dengan Inter Milan pada bursa transer musim panas 2018, dengan biaya 38 juta euro ditambah Nicolo Zaniolo yang pindah ke arah sebaliknya.

Namun, selama berseragam Nerazzurri, pemain berdarah Batak tersebut gagal mereplikasikan performa apiknya di AS Roma.

Dalam 2 musim terakhir, ia tersingkir dari tim utama sehingga akhirnya dipinjamkan ke Cagliari. Secara total, sejak 2018 Nainggolan hanya 41 kali membela Inter dengan sumbangan 7 gol dan 3 assist.