Usai pensiun sebagai pemain sepak bola, Javier Roca mulai menekuni dunia kepelatihan dan mengawali kiprahnya dengan melatih tim junior bernama Young Warrior. 

Young Warrior merupakan akademi sepak bola dari Indonesia yang didirikan oleh artis Darius Sinathrya dan rekannya, Michael Jantzen. Roca tak sendirian melatih di sana, ia juga bersama dengan Yopi Riwoe. 

Hal ini diketahui dari postingan di media sosial Javier Roca, baik itu instagram maupun twitter. Roca pemain yang gemar mengupdate kegiatannya di media sosial. 

Selain Young Warrior, klub lain yang pernah dilatih Javier Roca adalah Edf La Liga Academy, sebuah akademi sepak bola yang ada di kawasan Jakarta.

Sebelum resmi jadi pelatih Persik, Javier Roca sudah memegang lisensi kepelatihan Pro License A yang dikeluarkan federasi sepak bola Chile.

Bahkan saat tampil di kompetisi Liga Chile, Javier Roca berhasil membawa klub Santa Cruz promosi ke Liga 2 Chile. Tak cuma sebagai pelatih, Roca juga merupakan trainer bagi calon pelatih yang mengurus lisensi di National Football Institute (INAF) Chile.