Pada babak nasional, Persikota berada di Grup A bersa dengan Galaticos FC, Persikasi Bekasi dan Persepam Manokwari. Tim Biru Kuning juga jadi tuan rumah babak nasional Liga 3 2021 Grup A dan B yang digelar di Stadion Benteng Lama.

Sahala Saragih mengatakan senang dengan hasil drawing babak nasional karena bertemu tim baru. Dia menilai ini merupakan kesempatan bagi setiap tim untuk adu taktik dan strategi.

Persikota Tangerang ditargetkan promosi ke Liga 2 musim depan. Untuk mencapai hal itu, tim asal Tangerang butuh lolos babak 8 besar Liga 3 karena PSSI menyediakan delapan tiket promosi.