Memasuki babak kedua, Shin Tae-yong melakukan tiga pergantian pemain Timnas Indonesia. Elkan Baggott, Kadek Agung, dan Evan Dimas dipercaya menjadi tumpuan tim.

Namun, Chanathip Songkrasin benar-benar menjadi mimpi buruk bagi Indonesia. Melalui serangan balik, kapten Gajah Perang bisa menjebol gawang Nadeo di menit ke-52.

Kualitas Thailand kembali terlihat dengan gol Supachok Sarachat pada menit ke-67, yang gagal dihalau oleh Elkan Baggott dkk.

Bordin Phala mempertegas supremasi Thailand. Ketika pemain bertahan Indonesia gagal membuang bola dengan sempurna, ia  mengakhirinya dengan gol di menit ke-83.

Skor 4-0 untuk kemenangan Thailand, membuat Indonesia seolah tidak punya harapan di final leg kedua Piala AFF 2022.

Cobaan belum habis untuk skuat Timnas Indonesia. Jelang final leg kedua, beberapa pemain mendapat sanksi larangan bermain karena dianggap melanggar sistem bubble.

Mereka adalah Elkan Baggott, Rizky Ridho, Victor Igbonefo, dan Rizky Dwi yang dituduh melewati batas bubble yang diterapkan, sehingga harus mengikuti karantina.

Indonesia tentu menganggap ini akal-akalan saja, pasalnya pelanggaran yang dimaksud terjadi pada tanggal 15 Desember, dan para pemain sempat berlaga saat 29 Desember.

Namun, nasi sudah menjadi bubur. Timnas Indonesia tanpa pemain andalan di final leg kedua Piala AFF 2020 melawan Thailand.

Babak final leg kedua dihelat di Stadion Nasional Singapura pada 1 Januari 2022, dan berakhir dengan skor imbang 2-2. Egy Maulana dan Ricky Kambuaya mencetak gol.